Hoje concluimos a extracção pelo método de fenol-clorofórmio.
Soluções utilizadas:
- NaCl 5M
Para ajudar a precipitar o DNA
- Fenol:clorofórmio:álcool isoamílico (25:24:1) / Clorofórmio:álcool isoamílico (24:1)
Desnaturam e removem as proteínas
Formam-se 2 camadas, contendo o DNA na superior e na inferior as proteínas
Extrai-se apenas a camada que contém DNA
Nota: esta parte do processo desenvolveu-se na câmara de fluxo laminar (vertical) por motivos de segurança
- Etanol 96%
Precipita o DNA
Recorreu-se à centrifugação, a um repouso a -20ºC e à incubação a 37ºC
- QUANTIFICAÇÃO
Este processo permite-nos determinar a quantidade de DNA, RNA e proteínas presentes na amostra. É importante que haja uma grande quantidade de DNA para seguir para o PCR e pouca quantidade de RNA e proteínas para que não interfiram no processo de amplificação.
Quant-iT Assay Kit é o nome do kit utilizado para realizar este processo(http://www.probes.invitrogen.com/handbook/sections/0803.html)
Aparelho utilizado para quantificação
Resultados
Método de Chelex
- DNA suficiente
- pouca quantidade de RNA e proteínas
Pronto para PCR
Método de Fenol
- Pouca quantidade de DNA
- pouca quantidade de RNA e proteínas
Apesar de conter pouco DNA, as quantidades de RNA e proteínas são inferiores à de DNA, estando, assim, pronto para PCR.
Fiquem atentos ao próximo post...
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